More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1708 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  100 
 
 		 470 aa  902    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  44.35 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  47.46 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  45.72 
 
 		 485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  45.83 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  43.49 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  44 
 
 		 455 aa  363  4e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  40.68 
 
 		 460 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  39.32 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  40 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  40.23 
 
 		 457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  39.49 
 
 		 437 aa  323  4e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  39.72 
 
 		 437 aa  323  5e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  37.36 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  37.25 
 
 		 454 aa  306  6e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.96 
 
 		 460 aa  186  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 456 aa  172  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  30.92 
 
 		 500 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  32.48 
 
 		 485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  32.12 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 455 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 498 aa  156  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  31.5 
 
 		 499 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 477 aa  149  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0849  multi antimicrobial extrusion protein MatE  42.08 
 
 		 190 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.471879  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 554 aa  146  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.66 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  30 
 
 		 484 aa  143  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  32.23 
 
 		 470 aa  143  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 462 aa  143  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  30.43 
 
 		 518 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  33.44 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 538 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 525 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  30.99 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  27.49 
 
 		 455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  26.89 
 
 		 451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  38.95 
 
 		 210 aa  136  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 447 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.72 
 
 		 462 aa  130  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 454 aa  128  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 460 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 485 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.99 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 455 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 461 aa  122  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 449 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 462 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  28.53 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 442 aa  117  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  24.44 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  25.93 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  32 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.75 
 
 		 496 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.93 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 463 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  28.34 
 
 		 464 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 500 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 470 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>