More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0381 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  100 
 
 		 451 aa  913    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  38.64 
 
 		 468 aa  323  5e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  30.24 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  33.64 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  32.61 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  31.19 
 
 		 455 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  32.31 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 499 aa  225  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 486 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 477 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  28.99 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 485 aa  213  7.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 490 aa  210  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  29.39 
 
 		 538 aa  208  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  32.12 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 518 aa  196  9e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.68 
 
 		 454 aa  192  9e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 554 aa  187  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 500 aa  187  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 525 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 448 aa  177  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  28.72 
 
 		 505 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 498 aa  176  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 460 aa  166  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  26.18 
 
 		 496 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 453 aa  149  8e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.17 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  26.28 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  26.28 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  25.49 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  26.28 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 484 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.22 
 
 		 469 aa  143  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 443 aa  143  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1007  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.63 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  26.28 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  26.06 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  26.06 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 437 aa  140  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.46 
 
 		 485 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 437 aa  137  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  25 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.97 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 449 aa  133  6.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  23.11 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  22.94 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  25.3 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.01 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  22.65 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 475 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.14 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 464 aa  126  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 524 aa  126  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 471 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 456 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>