More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0293 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  100 
 
 		 467 aa  943    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  43.33 
 
 		 453 aa  398  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  42.13 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  39.46 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 500 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 468 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  30 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.17 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 462 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 518 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 454 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  24.15 
 
 		 469 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.69 
 
 		 469 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 448 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 481 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  24.15 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.72 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  23.94 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  23.94 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  23.94 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  23.73 
 
 		 469 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  23.73 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 480 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  27.29 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 437 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 443 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  21.67 
 
 		 554 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 490 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  23.34 
 
 		 538 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 525 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.62 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 450 aa  124  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 456 aa  123  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.74 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 458 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  23.62 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 498 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 449 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  23.18 
 
 		 447 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 458 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  28.68 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  25.46 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.05 
 
 		 496 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 454 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 505 aa  113  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.78 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  25.65 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  24.48 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  23.68 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 486 aa  110  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  23.04 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  22.91 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>