More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1252 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  100 
 
 		 445 aa  892    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  42.33 
 
 		 454 aa  348  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  38.9 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  35.09 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  32.57 
 
 		 446 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  30.66 
 
 		 478 aa  209  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  29.8 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  30.02 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  29.75 
 
 		 502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  28.51 
 
 		 474 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  28.67 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  29.05 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  28.51 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  28.28 
 
 		 474 aa  193  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  28.98 
 
 		 546 aa  192  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  28.82 
 
 		 547 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  30.82 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  28.82 
 
 		 547 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  28.82 
 
 		 546 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  29.8 
 
 		 495 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  28.38 
 
 		 484 aa  189  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  30.4 
 
 		 480 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  31.72 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  31.57 
 
 		 464 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  31.57 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  31.57 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  31.57 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  31.57 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  31.35 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  31.19 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  31.57 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  31.57 
 
 		 464 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 464 aa  166  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  30.99 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 475 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 462 aa  149  9e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  28.22 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 483 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  26.12 
 
 		 429 aa  130  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 446 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  26.36 
 
 		 440 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  26.09 
 
 		 439 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  25 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  26.61 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 459 aa  123  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 447 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 554 aa  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  28.46 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 446 aa  118  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 453 aa  117  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  24.07 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  22.9 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.75 
 
 		 462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 450 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 490 aa  113  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  28.1 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  22.59 
 
 		 472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 470 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 448 aa  109  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  25.9 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>