More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0875 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  100 
 
 		 446 aa  896    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  66.44 
 
 		 446 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  56.04 
 
 		 454 aa  485  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  38.9 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  29.64 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  27.64 
 
 		 547 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 495 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  27.64 
 
 		 547 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  27.64 
 
 		 546 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  27.66 
 
 		 495 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  27.64 
 
 		 484 aa  183  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  27.66 
 
 		 546 aa  183  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  27.42 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  27.79 
 
 		 471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  28.1 
 
 		 478 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  28.03 
 
 		 476 aa  176  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  27.52 
 
 		 474 aa  176  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  27.96 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  26.12 
 
 		 476 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  26.12 
 
 		 474 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  26.67 
 
 		 474 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  26.36 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  26.76 
 
 		 480 aa  156  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  28.51 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 464 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  28.07 
 
 		 464 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 464 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  28.07 
 
 		 464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 464 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  24.38 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 485 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 450 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  24.67 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 446 aa  126  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 525 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.46 
 
 		 538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25 
 
 		 453 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  25.49 
 
 		 440 aa  117  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  24.53 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  24.36 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  22.48 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 438 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 451 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 445 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 454 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  23.24 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  23.08 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  24.04 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  21.17 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  24.24 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  24 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.81 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.81 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  22.99 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.81 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  21.51 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  23.75 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.06 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  23.75 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 446 aa  99  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  24.69 
 
 		 469 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 483 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 450 aa  97.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.09 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  20.83 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>