More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18490 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  100 
 
 		 442 aa  872    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  46.38 
 
 		 450 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  44.09 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  44.82 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  39.23 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  39.55 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  39.55 
 
 		 464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  39.55 
 
 		 464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  39.55 
 
 		 464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  39.55 
 
 		 464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  39.09 
 
 		 463 aa  326  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  39.77 
 
 		 464 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  39.32 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  38.64 
 
 		 464 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  39.09 
 
 		 464 aa  322  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  35.39 
 
 		 446 aa  269  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  33.03 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  34.62 
 
 		 446 aa  256  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  34.7 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  34.01 
 
 		 453 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  32.51 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  33.03 
 
 		 453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 453 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  34.39 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  32.28 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  32.73 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  33.78 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  34.01 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  31.83 
 
 		 439 aa  233  6e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  31.52 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 469 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.67 
 
 		 555 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  29.18 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 438 aa  167  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  26.09 
 
 		 458 aa  153  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  28.08 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 459 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  26.65 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 446 aa  139  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  26.49 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 461 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25.76 
 
 		 502 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.34 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  25.78 
 
 		 474 aa  133  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 450 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  25.34 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  25.34 
 
 		 546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  25.34 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.34 
 
 		 495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  26.59 
 
 		 474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  25.44 
 
 		 546 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  26.59 
 
 		 474 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  24.89 
 
 		 484 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  25.33 
 
 		 476 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  26.37 
 
 		 476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  25.49 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 447 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 445 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.69 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  25.92 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  26.3 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  26.13 
 
 		 480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 468 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  26 
 
 		 466 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 486 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  22.92 
 
 		 459 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 412 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  24.32 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  25.11 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 458 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  24.15 
 
 		 454 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>