More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3106 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  78.83 
 
 		 547 aa  758    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  78.83 
 
 		 495 aa  756    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  78.01 
 
 		 484 aa  756    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  959    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  78.41 
 
 		 546 aa  755    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  78.41 
 
 		 495 aa  752    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  78.83 
 
 		 547 aa  758    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  78.66 
 
 		 546 aa  758    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  83.9 
 
 		 480 aa  779    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  78.01 
 
 		 484 aa  756    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  68.48 
 
 		 476 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  68.48 
 
 		 474 aa  631  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  67.31 
 
 		 478 aa  625  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  66.74 
 
 		 502 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  65.43 
 
 		 476 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  65.21 
 
 		 474 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  65.43 
 
 		 474 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  31.29 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  30.82 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  29.73 
 
 		 469 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  26.36 
 
 		 446 aa  176  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  27.15 
 
 		 446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 456 aa  156  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  29.21 
 
 		 471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 469 aa  150  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  28.63 
 
 		 459 aa  147  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  27.29 
 
 		 439 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.96 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 483 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 450 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 447 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 464 aa  130  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 447 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  26.16 
 
 		 440 aa  127  7e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26.67 
 
 		 463 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  24.61 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  26.81 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.73 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  26.23 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 475 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  30.29 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  25.05 
 
 		 472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  22.92 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  23.69 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  26.22 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 453 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 500 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 450 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.22 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 452 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  26.86 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  26.65 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 412 aa  98.2  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  22.74 
 
 		 484 aa  97.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  26.11 
 
 		 457 aa  97.4  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 470 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  28.03 
 
 		 452 aa  96.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 444 aa  95.1  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  26.27 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  22.69 
 
 		 461 aa  94  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 438 aa  94  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 438 aa  93.6  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  26.21 
 
 		 457 aa  93.2  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  26.21 
 
 		 457 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>