More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1724 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 471 aa  937    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  28.15 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  30.47 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 454 aa  202  7e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  29.12 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  26.55 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  27.02 
 
 		 474 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  29.18 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  26.58 
 
 		 484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.37 
 
 		 546 aa  163  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  26.37 
 
 		 546 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 495 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  26.37 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  26.37 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26.53 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  26.6 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  26.6 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  26.74 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  26.92 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  26.89 
 
 		 495 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  28.35 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25.39 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 446 aa  133  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 464 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  25.89 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.45 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  25.45 
 
 		 464 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  29.64 
 
 		 453 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  26.19 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  25.9 
 
 		 439 aa  113  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  24.95 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 464 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 446 aa  108  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 464 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 452 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  28.81 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.86 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  23.01 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  22.59 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 454 aa  97.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  23.58 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 464 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.03 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22.03 
 
 		 469 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  23.76 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  22.41 
 
 		 469 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  22.22 
 
 		 469 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  22.55 
 
 		 448 aa  90.5  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 458 aa  89.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  21.6 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  21.6 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  21.6 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 479 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  22.65 
 
 		 440 aa  89.7  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  24 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  21.6 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  21.6 
 
 		 469 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  22.02 
 
 		 451 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  22.83 
 
 		 483 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  22.94 
 
 		 448 aa  87  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  21.62 
 
 		 438 aa  87  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.21 
 
 		 554 aa  87  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  22.62 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  20.51 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  22.12 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  20.28 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>