More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0536 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  100 
 
 		 440 aa  869    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  58.9 
 
 		 439 aa  544  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  60.05 
 
 		 439 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  56.59 
 
 		 440 aa  491  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  52.62 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  52.39 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  51.71 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  48.97 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  40.41 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  34.85 
 
 		 450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  34.17 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  34.09 
 
 		 456 aa  262  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 463 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  34.39 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  33.33 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  33.33 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  33.72 
 
 		 464 aa  253  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  32.57 
 
 		 464 aa  253  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 464 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  33.94 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 464 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  33.78 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  30.98 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  30.45 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25 
 
 		 469 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  25.87 
 
 		 455 aa  143  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.54 
 
 		 555 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  24.14 
 
 		 458 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 445 aa  123  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  24.61 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  24.61 
 
 		 547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 495 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  24.61 
 
 		 547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.61 
 
 		 546 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  24.39 
 
 		 484 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  24.61 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.39 
 
 		 546 aa  117  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  25.49 
 
 		 446 aa  117  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  26.16 
 
 		 484 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 469 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  26.39 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  20.5 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  24.44 
 
 		 474 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  24.27 
 
 		 474 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  24.78 
 
 		 474 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  24.44 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 461 aa  107  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  22.81 
 
 		 453 aa  106  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  24.66 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  24.04 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25.56 
 
 		 502 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  25.22 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  22.57 
 
 		 461 aa  99  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  20.79 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 462 aa  97.1  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 483 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 462 aa  96.7  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 474 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  22.9 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 468 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 470 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  23.69 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 452 aa  93.6  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 455 aa  93.6  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 458 aa  93.2  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 458 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  22.37 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  22.76 
 
 		 454 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  20.81 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  20.81 
 
 		 463 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  23.39 
 
 		 459 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 450 aa  90.1  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  21.64 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  21.64 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  21.64 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  21.61 
 
 		 475 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>