More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000940 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 446 aa  879    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  92.38 
 
 		 446 aa  810    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  52.93 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  52.93 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  52.7 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  52.04 
 
 		 486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  51.25 
 
 		 453 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  52.04 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  52.26 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  52.04 
 
 		 453 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  51.58 
 
 		 476 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  39.18 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  41.08 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  39.86 
 
 		 450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  35.39 
 
 		 442 aa  269  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  35.54 
 
 		 464 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  35.62 
 
 		 464 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  35.54 
 
 		 464 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  35.54 
 
 		 464 aa  262  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  35.54 
 
 		 464 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  35.51 
 
 		 464 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  35.08 
 
 		 464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  35.08 
 
 		 463 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  35.08 
 
 		 464 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  33.87 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  35.08 
 
 		 464 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  32.73 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  32.72 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  30.82 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  30.98 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  29.98 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  29.16 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 469 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.75 
 
 		 555 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 464 aa  153  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  27.42 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  26.47 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 446 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 469 aa  126  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  26 
 
 		 502 aa  117  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  25.83 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 483 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 412 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  26.44 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  24.55 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 459 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  26.67 
 
 		 476 aa  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  25.39 
 
 		 461 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  26.35 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 467 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  24.78 
 
 		 474 aa  107  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  24.78 
 
 		 474 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  25.57 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  24.24 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  24.78 
 
 		 476 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.78 
 
 		 495 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  23.62 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 447 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  25.92 
 
 		 429 aa  99.8  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.06 
 
 		 484 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 481 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 495 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  25.06 
 
 		 546 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  25.06 
 
 		 547 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  25.06 
 
 		 547 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 459 aa  96.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  25.06 
 
 		 546 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  26.59 
 
 		 458 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>