More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0883 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  100 
 
 
451 aa  907    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  47.98 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  38.63 
 
 
453 aa  293  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  36.26 
 
 
477 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  34.86 
 
 
448 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  35.78 
 
 
445 aa  264  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  34.1 
 
 
446 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  35.92 
 
 
458 aa  257  3e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  36.43 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  37.08 
 
 
457 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  32.73 
 
 
443 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  35.35 
 
 
522 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  33.73 
 
 
442 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  32.28 
 
 
446 aa  236  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  35.46 
 
 
500 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  33.83 
 
 
446 aa  236  7e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  35.24 
 
 
494 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  33.33 
 
 
442 aa  217  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  35.94 
 
 
408 aa  203  5e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.51 
 
 
460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  29.95 
 
 
449 aa  190  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  30.41 
 
 
453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
468 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  27.1 
 
 
453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  27.97 
 
 
486 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  27.81 
 
 
496 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  28.92 
 
 
492 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  28.13 
 
 
469 aa  160  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  27.95 
 
 
469 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  27.95 
 
 
469 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
485 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  26.85 
 
 
469 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  26.85 
 
 
469 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  26.85 
 
 
469 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.06 
 
 
460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  26.85 
 
 
469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.85 
 
 
469 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  26.85 
 
 
469 aa  154  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
486 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  27.55 
 
 
469 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.76 
 
 
482 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
469 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  29.46 
 
 
462 aa  151  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.47 
 
 
462 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.1 
 
 
538 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  26.88 
 
 
503 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.21 
 
 
499 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.73 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
469 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
518 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  29.82 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.83 
 
 
500 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  26.24 
 
 
454 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
445 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28.85 
 
 
475 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
469 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
480 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  28.85 
 
 
455 aa  143  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  29.56 
 
 
462 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  29.59 
 
 
455 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  29.59 
 
 
455 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.54 
 
 
454 aa  143  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  24.84 
 
 
500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  28.08 
 
 
455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  26.16 
 
 
524 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
466 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.52 
 
 
475 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  27.32 
 
 
478 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24 
 
 
554 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.05 
 
 
500 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25.38 
 
 
490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.49 
 
 
477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  26.4 
 
 
438 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
451 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.8 
 
 
450 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
438 aa  132  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
481 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
461 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  26.43 
 
 
503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1507  mate efflux family protein  25.12 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.2 
 
 
438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.21 
 
 
525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  30.65 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  25.94 
 
 
449 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  29.26 
 
 
491 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
452 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.72 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  24.65 
 
 
456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  27.16 
 
 
476 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
521 aa  126  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  24.83 
 
 
446 aa  126  9e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  24.38 
 
 
472 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
445 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.13 
 
 
454 aa  124  3e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>