More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0111 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  100 
 
 		 464 aa  921    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  99.14 
 
 		 464 aa  911    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  38.88 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  32 
 
 		 461 aa  239  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  32.1 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  34.22 
 
 		 475 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  34.76 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  31.01 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  32.86 
 
 		 483 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  31.72 
 
 		 469 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  31.22 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  30.21 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  29.77 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 446 aa  189  5.999999999999999e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 447 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 460 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 447 aa  176  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 463 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  30.16 
 
 		 472 aa  166  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  30.48 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 463 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 464 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  25.06 
 
 		 463 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  29.69 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  25.52 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  25 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  25.92 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 495 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  25.92 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  29.93 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  25.92 
 
 		 546 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  29.05 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  25.92 
 
 		 546 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  29.93 
 
 		 453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  29.93 
 
 		 453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.92 
 
 		 484 aa  156  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25 
 
 		 464 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 464 aa  156  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  26.91 
 
 		 408 aa  156  9e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 464 aa  156  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  25.46 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  31.55 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  29 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  29.46 
 
 		 453 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 454 aa  154  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 446 aa  153  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  26.4 
 
 		 446 aa  153  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 464 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 455 aa  152  8.999999999999999e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.69 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  28.07 
 
 		 429 aa  151  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  31.16 
 
 		 454 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  32.39 
 
 		 452 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  28.51 
 
 		 466 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  27.35 
 
 		 446 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  29.93 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 468 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  27.38 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 525 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  28.15 
 
 		 452 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  28.15 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  25.96 
 
 		 454 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 490 aa  144  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 450 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 444 aa  143  5e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 500 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 505 aa  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 475 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 500 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 500 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>