More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09280 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  100 
 
 
453 aa  895    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  34.19 
 
 
475 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  34.76 
 
 
464 aa  225  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  34.76 
 
 
464 aa  225  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  30.15 
 
 
461 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  30.25 
 
 
469 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  32.03 
 
 
458 aa  210  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  29.45 
 
 
464 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  29.91 
 
 
459 aa  200  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.94 
 
 
469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.58 
 
 
468 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.86 
 
 
483 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  31.49 
 
 
450 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
467 aa  182  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
461 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  28.86 
 
 
438 aa  177  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.37 
 
 
462 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.38 
 
 
445 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.79 
 
 
469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  24.38 
 
 
463 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  24.38 
 
 
463 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  29.4 
 
 
446 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
470 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.37 
 
 
468 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  28.21 
 
 
464 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  27.17 
 
 
464 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
442 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
500 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  26.96 
 
 
464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  26.96 
 
 
464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  26.96 
 
 
464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
464 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  27.52 
 
 
464 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.34 
 
 
500 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
463 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
445 aa  150  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26.73 
 
 
463 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  30.2 
 
 
408 aa  150  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
464 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
461 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  28.24 
 
 
447 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  26.27 
 
 
464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  28.24 
 
 
447 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
456 aa  146  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  25.38 
 
 
453 aa  146  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  28.86 
 
 
450 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.18 
 
 
467 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
485 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  23.83 
 
 
463 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.44 
 
 
452 aa  144  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.29 
 
 
460 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.78 
 
 
484 aa  143  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  25.79 
 
 
453 aa  143  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  25.78 
 
 
547 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
495 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  25.78 
 
 
547 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  25.78 
 
 
546 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  25.78 
 
 
546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.78 
 
 
495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25 
 
 
538 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  25.56 
 
 
484 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
460 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
450 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  28.73 
 
 
450 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
451 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
456 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  28.08 
 
 
461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  28.99 
 
 
457 aa  138  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  27.73 
 
 
454 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.24 
 
 
454 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  28.23 
 
 
453 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  24.51 
 
 
486 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.4 
 
 
468 aa  136  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  22.86 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  27.96 
 
 
479 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
485 aa  134  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
461 aa  133  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.44 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  27.81 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
486 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  29.97 
 
 
452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  25.97 
 
 
462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
445 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.54 
 
 
454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  27.39 
 
 
445 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
446 aa  127  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  28.39 
 
 
452 aa  126  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
462 aa  126  9e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
475 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.05 
 
 
500 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  25.45 
 
 
446 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  22.67 
 
 
469 aa  126  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  22 
 
 
469 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22 
 
 
469 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.52 
 
 
499 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.68 
 
 
518 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>