More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1338 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  78.57 
 
 		 525 aa  689    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  100 
 
 		 481 aa  930    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  56.84 
 
 		 538 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  53.66 
 
 		 554 aa  503  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  52.65 
 
 		 485 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  44.12 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  41.7 
 
 		 499 aa  350  3e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  45.54 
 
 		 486 aa  348  9e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  39.64 
 
 		 498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  43.1 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  41.63 
 
 		 490 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  37.35 
 
 		 500 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  36.94 
 
 		 518 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  36.82 
 
 		 505 aa  286  5.999999999999999e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  36.46 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  37.47 
 
 		 500 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  32.71 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  35.47 
 
 		 500 aa  252  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 448 aa  196  7e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.55 
 
 		 460 aa  196  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 462 aa  196  9e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  30.13 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  30.17 
 
 		 496 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 445 aa  192  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  30.68 
 
 		 454 aa  189  5.999999999999999e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  29.68 
 
 		 464 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 477 aa  189  7e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 453 aa  187  5e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 467 aa  174  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  30.29 
 
 		 492 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  33.05 
 
 		 466 aa  170  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 475 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  30.2 
 
 		 469 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  29.54 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  29.54 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  29.54 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 448 aa  164  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  29.03 
 
 		 482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 453 aa  163  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  29.22 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  29.54 
 
 		 469 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  28.72 
 
 		 469 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 446 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  29.32 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  26 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.48 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 475 aa  156  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 469 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 469 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 456 aa  153  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  32.92 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 486 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 458 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 453 aa  143  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  28.51 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 464 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 478 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 464 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 438 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 521 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 455 aa  136  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 461 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 454 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.14 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>