More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_1621 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  100 
 
 
469 aa  933    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  72.65 
 
 
478 aa  663    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  99.36 
 
 
469 aa  929    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  85.71 
 
 
469 aa  803    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  100 
 
 
469 aa  933    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  100 
 
 
469 aa  933    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  84.86 
 
 
469 aa  777    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  85.71 
 
 
469 aa  803    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  89.13 
 
 
469 aa  825    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  98.29 
 
 
469 aa  919    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  86.14 
 
 
469 aa  786    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  96.8 
 
 
469 aa  892    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  99.36 
 
 
469 aa  928    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  98.51 
 
 
469 aa  921    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  73.08 
 
 
480 aa  664    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  58.96 
 
 
476 aa  546  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  100 
 
 
238 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  99.17 
 
 
270 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  47.33 
 
 
449 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  44.19 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  43.34 
 
 
455 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  43.34 
 
 
455 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  46.78 
 
 
449 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  41.76 
 
 
455 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  47.15 
 
 
436 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  40.75 
 
 
472 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  39.16 
 
 
491 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  39.26 
 
 
458 aa  349  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  37.89 
 
 
496 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  37.22 
 
 
492 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  36.61 
 
 
486 aa  286  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  34.2 
 
 
503 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  35.46 
 
 
524 aa  278  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  32.55 
 
 
521 aa  273  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  36.26 
 
 
503 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  32 
 
 
482 aa  256  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  33.7 
 
 
494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  29.8 
 
 
448 aa  206  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  33.03 
 
 
481 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  29.8 
 
 
465 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.32 
 
 
460 aa  196  6e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
462 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.41 
 
 
486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.99 
 
 
468 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  29.52 
 
 
448 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.9 
 
 
500 aa  180  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  29.56 
 
 
453 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.09 
 
 
457 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  27.49 
 
 
485 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.74 
 
 
500 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  29.65 
 
 
449 aa  170  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
500 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
538 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.49 
 
 
525 aa  167  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.5 
 
 
445 aa  166  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  27.6 
 
 
453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.09 
 
 
485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  28.14 
 
 
446 aa  164  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.08 
 
 
477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
445 aa  162  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
453 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
490 aa  160  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.54 
 
 
481 aa  160  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
454 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  23.89 
 
 
518 aa  159  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  29.1 
 
 
522 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  28.94 
 
 
442 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.2 
 
 
498 aa  156  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
499 aa  156  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.43 
 
 
467 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
458 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
462 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  27.25 
 
 
443 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.64 
 
 
458 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.19 
 
 
460 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.94 
 
 
554 aa  149  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.02 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.48 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.02 
 
 
448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.54 
 
 
461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
451 aa  146  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  30.49 
 
 
458 aa  146  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.3 
 
 
461 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  28.12 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.24 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  25.46 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.45 
 
 
453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.67 
 
 
475 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.28 
 
 
451 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  23.94 
 
 
467 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  24.01 
 
 
469 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.85 
 
 
461 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  22.77 
 
 
470 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
470 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.63 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  29.35 
 
 
494 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.52 
 
 
453 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  26.46 
 
 
446 aa  133  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  25.17 
 
 
463 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  22.42 
 
 
469 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>