More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0347 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  100 
 
 
454 aa  895    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  56.04 
 
 
446 aa  503  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  51.12 
 
 
446 aa  433  1e-120  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  42.33 
 
 
445 aa  358  9e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  29.32 
 
 
446 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  30.82 
 
 
484 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  30.59 
 
 
495 aa  203  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  30.59 
 
 
547 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  30.59 
 
 
546 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  30.59 
 
 
547 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  30.37 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  30.37 
 
 
546 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  30.37 
 
 
495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  28.51 
 
 
471 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  31.52 
 
 
480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  29.82 
 
 
474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  30.6 
 
 
469 aa  179  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  29.82 
 
 
476 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  28.88 
 
 
478 aa  173  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  29.45 
 
 
484 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  28.25 
 
 
474 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  28.25 
 
 
476 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  29.21 
 
 
502 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  28.03 
 
 
474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
464 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
475 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  27.5 
 
 
463 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
464 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  27.11 
 
 
464 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  27.11 
 
 
464 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  27.11 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  27.11 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  27.11 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  27.11 
 
 
464 aa  153  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  26.88 
 
 
464 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
463 aa  150  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
456 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.48 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.59 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  27.38 
 
 
439 aa  139  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
448 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  26.56 
 
 
439 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  26.02 
 
 
450 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  27.27 
 
 
440 aa  131  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.83 
 
 
458 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.78 
 
 
475 aa  126  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
446 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  30.23 
 
 
462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.07 
 
 
468 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.74 
 
 
464 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
464 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  22.53 
 
 
464 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
464 aa  119  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  26.93 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  22.78 
 
 
459 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  26.19 
 
 
429 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
412 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.61 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
446 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
451 aa  113  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  25.5 
 
 
440 aa  113  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  24.53 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.19 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  24.3 
 
 
438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  24.07 
 
 
438 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.26 
 
 
445 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
457 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  24.6 
 
 
438 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  28.27 
 
 
453 aa  108  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.58 
 
 
448 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
469 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.15 
 
 
452 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.1 
 
 
453 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  24.26 
 
 
460 aa  107  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  24.74 
 
 
469 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  24.74 
 
 
469 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  24.33 
 
 
469 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  26.23 
 
 
458 aa  106  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
442 aa  106  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
457 aa  106  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
450 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.29 
 
 
460 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  20.5 
 
 
467 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.59 
 
 
460 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
469 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  24.67 
 
 
442 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  24.52 
 
 
460 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.55 
 
 
469 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.55 
 
 
469 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.55 
 
 
469 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.55 
 
 
469 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  24.55 
 
 
469 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  23.64 
 
 
496 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  24.78 
 
 
469 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  22.1 
 
 
453 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>