277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0795 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  78.08 
 
 		 438 aa  703    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  78.31 
 
 		 438 aa  700    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  100 
 
 		 438 aa  868    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  78.31 
 
 		 438 aa  702    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  51.37 
 
 		 439 aa  437  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  51.83 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  48.97 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  48.52 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  37.64 
 
 		 446 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  33.64 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  30.65 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 450 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 456 aa  202  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  31.14 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  31.14 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  30.91 
 
 		 463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 464 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  31.07 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  27.42 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  27.23 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 476 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 486 aa  123  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  25.34 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 453 aa  116  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.57 
 
 		 469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  22.57 
 
 		 475 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  24.04 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  24.43 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 458 aa  107  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.61 
 
 		 555 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 467 aa  97.1  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.66 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  24.77 
 
 		 446 aa  92.8  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  22.82 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  22.9 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  23.37 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  23.15 
 
 		 458 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  22.78 
 
 		 480 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  21.6 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  21.1 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  24.72 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  23.36 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.2 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.2 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  23.13 
 
 		 546 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  23.2 
 
 		 546 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  21.46 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  22.7 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  22.7 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  22.9 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  24.58 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  24.05 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  23.37 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  24.11 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  24.11 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  25.22 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  24.11 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  22.12 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  21 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  23.22 
 
 		 474 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  22.7 
 
 		 470 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  23.32 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  21.21 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  21.21 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  23.8 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  21.57 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  21.95 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  22.07 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  21.35 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  21.35 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>