297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0648 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  99.32 
 
 
438 aa  873    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  78.31 
 
 
438 aa  702    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  97.03 
 
 
438 aa  855    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  100 
 
 
438 aa  877    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  51.6 
 
 
439 aa  442  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  52.62 
 
 
440 aa  429  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  50.46 
 
 
439 aa  427  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  51.03 
 
 
440 aa  420  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  36.51 
 
 
446 aa  286  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  32.51 
 
 
450 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  30.91 
 
 
463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  30.25 
 
 
464 aa  212  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  30.86 
 
 
464 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  30.93 
 
 
464 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  30.86 
 
 
464 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  30.86 
 
 
464 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  30.86 
 
 
464 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  30.86 
 
 
464 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  30.7 
 
 
463 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  30.77 
 
 
456 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  30.7 
 
 
464 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  30.63 
 
 
464 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  32.07 
 
 
450 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  27.67 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  28.79 
 
 
442 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  27.75 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  27.11 
 
 
446 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  29.06 
 
 
453 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  29.22 
 
 
453 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  28.77 
 
 
453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  29 
 
 
476 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  27.06 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  25.4 
 
 
458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
456 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
456 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.71 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  26.71 
 
 
453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.09 
 
 
458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  25.17 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  26.8 
 
 
455 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  24.77 
 
 
446 aa  110  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  21.29 
 
 
475 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  23.52 
 
 
445 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
454 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  22.48 
 
 
459 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  22.25 
 
 
459 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  25.26 
 
 
467 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  20.09 
 
 
461 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  23.23 
 
 
484 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
458 aa  89.7  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  25.06 
 
 
484 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  24.59 
 
 
458 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  22.55 
 
 
547 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.01 
 
 
495 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  22.55 
 
 
547 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  22.55 
 
 
546 aa  89  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  22.35 
 
 
462 aa  87.8  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  22.55 
 
 
546 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  21.53 
 
 
450 aa  87  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.36 
 
 
484 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  22.78 
 
 
495 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.49 
 
 
464 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  22.25 
 
 
480 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  23.27 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.49 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  21.66 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  22.84 
 
 
555 aa  84  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  24.4 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  22.43 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.39 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  22.97 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  20.41 
 
 
464 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  23.53 
 
 
463 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  23.53 
 
 
463 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  22.7 
 
 
474 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  22.7 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  22.05 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  22.53 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  22.7 
 
 
476 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  24.52 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  24.5 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  20.28 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  21.23 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  21.2 
 
 
429 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  23.39 
 
 
476 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  20.28 
 
 
445 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  20.48 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  23.94 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  24.07 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  23.01 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  21.97 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  24.77 
 
 
502 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  21 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  20.99 
 
 
461 aa  67  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  22.45 
 
 
470 aa  66.6  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  22.62 
 
 
477 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  21.91 
 
 
461 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  22.83 
 
 
486 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  23.16 
 
 
472 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>