More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0931 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  100 
 
 		 448 aa  888    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  38.74 
 
 		 448 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  35.97 
 
 		 453 aa  277  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  37.09 
 
 		 446 aa  259  7e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  37.93 
 
 		 443 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  36.2 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  36.49 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  32.35 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  36.43 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  34.07 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  33.26 
 
 		 496 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  32.58 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  35.81 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  35.59 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  32.82 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  32.43 
 
 		 442 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 469 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 469 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  30.25 
 
 		 469 aa  220  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  29.8 
 
 		 469 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  29.8 
 
 		 469 aa  219  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  29.8 
 
 		 469 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  29.8 
 
 		 469 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  29.8 
 
 		 469 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  29.8 
 
 		 469 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  34.76 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  34.38 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  32.21 
 
 		 521 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  31.86 
 
 		 480 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  30.09 
 
 		 477 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  31.97 
 
 		 454 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  31.5 
 
 		 503 aa  207  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  31.01 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  31.9 
 
 		 478 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  31.51 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  31.8 
 
 		 455 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  32.29 
 
 		 458 aa  199  6e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  32.72 
 
 		 482 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  32.87 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  32.87 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  29.07 
 
 		 472 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  31.57 
 
 		 522 aa  196  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  29.49 
 
 		 491 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 462 aa  193  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 453 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 455 aa  189  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  34.15 
 
 		 503 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 445 aa  189  7e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  31.15 
 
 		 476 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.45 
 
 		 500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  31.22 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 499 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.22 
 
 		 486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 538 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 451 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 554 aa  179  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  29.38 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  30.38 
 
 		 500 aa  177  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  29.75 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.72 
 
 		 462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 500 aa  173  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 494 aa  173  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.63 
 
 		 481 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  27.6 
 
 		 470 aa  169  8e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 494 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  28 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.99 
 
 		 525 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 465 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 490 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 458 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  30.85 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.3 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.2 
 
 		 518 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 475 aa  155  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.94 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.86 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 505 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 453 aa  147  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>