More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0906 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  100 
 
 		 448 aa  885    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  51.35 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  39.91 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  34.29 
 
 		 477 aa  237  4e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  29.96 
 
 		 500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  29 
 
 		 500 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 525 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 462 aa  194  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  32.12 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 461 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 461 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.11 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 518 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  29.09 
 
 		 538 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 470 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 475 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 460 aa  160  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 498 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 475 aa  160  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28 
 
 		 490 aa  159  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 475 aa  152  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 453 aa  149  9e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.79 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  24.77 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  23.76 
 
 		 496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 469 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 469 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 440 aa  139  7e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 469 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.02 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.02 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.02 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.02 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  24.02 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  26.72 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  24.89 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25 
 
 		 468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  23.79 
 
 		 469 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  23.79 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 460 aa  129  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 468 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 452 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 462 aa  127  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 458 aa  126  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 467 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 480 aa  126  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  24.67 
 
 		 503 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  23.22 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24 
 
 		 464 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  25 
 
 		 436 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  26.62 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 478 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>