More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2347 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  100 
 
 
476 aa  929    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  59.05 
 
 
469 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  58.96 
 
 
469 aa  565  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  58.96 
 
 
469 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  58.96 
 
 
469 aa  566  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  58.62 
 
 
469 aa  566  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  58.96 
 
 
469 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  59.4 
 
 
469 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  57.72 
 
 
469 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  59.1 
 
 
469 aa  559  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  59.33 
 
 
469 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  59.33 
 
 
469 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  59.96 
 
 
469 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  58.91 
 
 
469 aa  535  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  60.39 
 
 
480 aa  532  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  57.68 
 
 
478 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  49.22 
 
 
471 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  46.26 
 
 
455 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  46.26 
 
 
455 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  47.17 
 
 
455 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  47.2 
 
 
449 aa  360  4e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  45.45 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  41.23 
 
 
491 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  43.62 
 
 
472 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  44.98 
 
 
436 aa  335  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  40.7 
 
 
458 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  62.34 
 
 
270 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  54.15 
 
 
238 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  37.53 
 
 
503 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  36.6 
 
 
503 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  36.79 
 
 
496 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  36.78 
 
 
486 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  35.65 
 
 
521 aa  253  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  36.34 
 
 
492 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  35.84 
 
 
524 aa  247  4e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  36.71 
 
 
494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  34.5 
 
 
482 aa  226  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.93 
 
 
460 aa  190  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  31.15 
 
 
448 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  34.73 
 
 
481 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  30 
 
 
465 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  31.23 
 
 
442 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.25 
 
 
486 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  28.85 
 
 
453 aa  161  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
453 aa  159  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
448 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.17 
 
 
462 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  28.76 
 
 
446 aa  146  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  29.28 
 
 
500 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
461 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.9 
 
 
490 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.64 
 
 
468 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  26.91 
 
 
453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.97 
 
 
485 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  29.66 
 
 
458 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.88 
 
 
454 aa  136  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.71 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
485 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29.02 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  30.07 
 
 
525 aa  133  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.25 
 
 
518 aa  133  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.66 
 
 
462 aa  131  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.84 
 
 
481 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
445 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.14 
 
 
500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.24 
 
 
470 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  29.41 
 
 
477 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  25.87 
 
 
457 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.63 
 
 
538 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  26.49 
 
 
449 aa  123  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  24.73 
 
 
477 aa  123  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
453 aa  123  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
451 aa  123  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
453 aa  122  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.23 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.12 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  29.21 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.68 
 
 
499 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  29.95 
 
 
522 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
464 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.63 
 
 
454 aa  120  7e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  27.76 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.25 
 
 
554 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  23.13 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25 
 
 
462 aa  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  25.54 
 
 
452 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  24.4 
 
 
445 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  24.59 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.81 
 
 
463 aa  111  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  25.19 
 
 
451 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
455 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
455 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>