More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3762 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  100 
 
 		 442 aa  877    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  38.63 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  35.24 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  35.48 
 
 		 443 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  31.98 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  32.37 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  33.49 
 
 		 453 aa  221  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  31.64 
 
 		 446 aa  220  5e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  35.81 
 
 		 448 aa  219  7.999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  33.73 
 
 		 451 aa  217  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  31.99 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  32.35 
 
 		 500 aa  206  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  32.05 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 522 aa  202  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  32.21 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  31.53 
 
 		 457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  32.18 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  32.9 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 494 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  29.16 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  31.03 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  29.89 
 
 		 503 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  30 
 
 		 454 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 469 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  32.49 
 
 		 486 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  30.4 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  30.14 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  30.4 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  28.94 
 
 		 469 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  28.94 
 
 		 469 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  28.94 
 
 		 469 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  28.94 
 
 		 469 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  28.94 
 
 		 469 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  28.5 
 
 		 468 aa  150  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 458 aa  149  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  28.94 
 
 		 469 aa  149  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  28.65 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  32.69 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 503 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 478 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 500 aa  136  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  31.95 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  31.4 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  31.4 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 521 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  29.38 
 
 		 482 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  27.46 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  28.21 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 445 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 498 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 449 aa  123  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 453 aa  123  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 465 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 518 aa  122  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 463 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 456 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 525 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  30.22 
 
 		 481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  23.51 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  29.15 
 
 		 436 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.75 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  30.19 
 
 		 238 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 554 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 458 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 455 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 458 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>