More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02151 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  100 
 
 
503 aa  985    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  71.55 
 
 
486 aa  654    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  62.02 
 
 
521 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  54.15 
 
 
492 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  51.84 
 
 
496 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  49.45 
 
 
482 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  45.4 
 
 
524 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  47.46 
 
 
503 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  47.17 
 
 
494 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  44.3 
 
 
465 aa  343  5.999999999999999e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  45.78 
 
 
481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  36.01 
 
 
469 aa  297  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  36.26 
 
 
469 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  36.49 
 
 
469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  36.26 
 
 
469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  36.26 
 
 
469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  36.1 
 
 
469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  36.26 
 
 
469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  36.49 
 
 
469 aa  287  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  36.26 
 
 
469 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  35.62 
 
 
469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  35.62 
 
 
469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  36.05 
 
 
469 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  35.62 
 
 
469 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  35.48 
 
 
478 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  37.61 
 
 
471 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  37.53 
 
 
476 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  37.73 
 
 
455 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  34.33 
 
 
480 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  37.1 
 
 
455 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  37.1 
 
 
455 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  35.65 
 
 
491 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  37 
 
 
449 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  35.6 
 
 
458 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  36.34 
 
 
436 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  35.19 
 
 
449 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  32.8 
 
 
472 aa  203  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.17 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  34.15 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  31.13 
 
 
454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  32.21 
 
 
486 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  30.04 
 
 
448 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.82 
 
 
485 aa  173  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.85 
 
 
468 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  27.53 
 
 
446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  29.25 
 
 
442 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  28.29 
 
 
457 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  30.12 
 
 
490 aa  161  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  30.32 
 
 
500 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
462 aa  156  7e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.15 
 
 
460 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.69 
 
 
525 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
453 aa  155  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.21 
 
 
500 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  27.09 
 
 
446 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.81 
 
 
499 aa  151  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28 
 
 
518 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  36.29 
 
 
270 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  26.34 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.76 
 
 
445 aa  146  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  36.02 
 
 
238 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.06 
 
 
481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.49 
 
 
500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  27.96 
 
 
449 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
538 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
448 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.08 
 
 
498 aa  136  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.46 
 
 
467 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  28.31 
 
 
477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.36 
 
 
463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.91 
 
 
462 aa  134  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
461 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  34.75 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.34 
 
 
485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
470 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
554 aa  130  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.03 
 
 
463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
461 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  30.92 
 
 
500 aa  126  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  29.28 
 
 
453 aa  127  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.07 
 
 
470 aa  126  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  27.61 
 
 
446 aa  125  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.6 
 
 
453 aa  123  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  29.87 
 
 
463 aa  123  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  26.43 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
467 aa  121  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  27.22 
 
 
522 aa  120  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
451 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.57 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.28 
 
 
452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.17 
 
 
454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.35 
 
 
475 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.05 
 
 
458 aa  117  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  30.37 
 
 
451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
455 aa  116  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
461 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  24.23 
 
 
445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>