More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1071 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  100 
 
 		 475 aa  950    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  75.27 
 
 		 475 aa  721    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  52.53 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  47.1 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  47.1 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  42.12 
 
 		 468 aa  353  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  38.9 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  32.06 
 
 		 445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  31.4 
 
 		 475 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28.45 
 
 		 475 aa  183  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 464 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  28.85 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 455 aa  162  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 500 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 448 aa  160  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 458 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 460 aa  156  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 499 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 486 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 453 aa  146  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 467 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  25.1 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 464 aa  143  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 464 aa  143  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 525 aa  140  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 459 aa  140  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 453 aa  140  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 469 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 498 aa  136  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  30.12 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.79 
 
 		 538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  28.33 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  23.13 
 
 		 492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.17 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  23.43 
 
 		 496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 485 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.81 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  28.46 
 
 		 437 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 455 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 486 aa  127  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 467 aa  126  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 503 aa  126  9e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.4 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 454 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  28.46 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 447 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 554 aa  124  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 449 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 448 aa  123  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 456 aa  123  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 458 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 454 aa  120  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 521 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 452 aa  117  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 524 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 461 aa  113  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 469 aa  113  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  22.89 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22.93 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  22.93 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  22.93 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  23.31 
 
 		 469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  23.16 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  22.93 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>