More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2827 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  100 
 
 		 451 aa  886    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  38.89 
 
 		 462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  38.88 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  39.23 
 
 		 454 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  38.74 
 
 		 452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  38.29 
 
 		 451 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  39.19 
 
 		 454 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  37.67 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  38.96 
 
 		 455 aa  299  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  37.84 
 
 		 455 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  37.84 
 
 		 455 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  37.61 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  37.61 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  39.64 
 
 		 453 aa  295  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  38.06 
 
 		 455 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  38.96 
 
 		 452 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  38.74 
 
 		 452 aa  289  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  38.64 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  38.06 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  36.38 
 
 		 456 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  36.26 
 
 		 459 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  37.41 
 
 		 460 aa  265  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  36.24 
 
 		 428 aa  250  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  35.63 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  34.69 
 
 		 478 aa  239  8e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  31.49 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 440 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  34.32 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  32.19 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  28.63 
 
 		 444 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  29.73 
 
 		 442 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  30.62 
 
 		 454 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 455 aa  177  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  30.7 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  30.91 
 
 		 469 aa  170  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 443 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 461 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 498 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 501 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 505 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 462 aa  147  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 464 aa  147  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 499 aa  147  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 517 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  24.25 
 
 		 456 aa  142  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  29.26 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 518 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 515 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 531 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 503 aa  140  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 453 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 470 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 458 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 477 aa  136  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  27.38 
 
 		 480 aa  136  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 458 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 516 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.53 
 
 		 456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 521 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 454 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 451 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.11 
 
 		 455 aa  133  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  28.45 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.9 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 484 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 470 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  26.92 
 
 		 481 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>