More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2111 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  67.8 
 
 		 505 aa  651    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  70.18 
 
 		 501 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  70.68 
 
 		 515 aa  673    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  66.73 
 
 		 509 aa  643    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  69.8 
 
 		 503 aa  673    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  69.73 
 
 		 520 aa  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  70 
 
 		 517 aa  668    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  67.05 
 
 		 516 aa  653    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  70.12 
 
 		 520 aa  672    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  100 
 
 		 505 aa  994    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  70.48 
 
 		 515 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  70.68 
 
 		 515 aa  674    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  71.95 
 
 		 495 aa  655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  70.68 
 
 		 515 aa  675    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  69.92 
 
 		 531 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  66.39 
 
 		 521 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  49.69 
 
 		 486 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  46.83 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  48.21 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  48.49 
 
 		 443 aa  353  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  42.92 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  46.59 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  44.32 
 
 		 459 aa  339  9e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  44.02 
 
 		 451 aa  336  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  44.66 
 
 		 434 aa  335  7.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  45.52 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  41.04 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  42.02 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  42.76 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  43.71 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  42.76 
 
 		 493 aa  287  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  43.94 
 
 		 481 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  30.82 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 454 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  32.67 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  32.51 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  29.47 
 
 		 451 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.69 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 455 aa  151  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 452 aa  148  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  30.61 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 453 aa  147  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 460 aa  143  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 455 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 453 aa  143  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  29.14 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  30.85 
 
 		 478 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 455 aa  136  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  24.46 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  28.97 
 
 		 427 aa  126  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  25.12 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  25.81 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 442 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  22.12 
 
 		 452 aa  114  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 462 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  26.48 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  22.97 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  31.24 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.53 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  23.89 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 453 aa  99.8  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  27.98 
 
 		 451 aa  97.1  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  27.98 
 
 		 451 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 451 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 451 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  29.09 
 
 		 485 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 440 aa  95.1  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 448 aa  94.7  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 457 aa  94.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  24.44 
 
 		 454 aa  94.4  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 468 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 454 aa  94  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 451 aa  94  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 447 aa  93.6  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.29 
 
 		 478 aa  93.2  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>