289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0370 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  100 
 
 		 458 aa  901    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  42.82 
 
 		 453 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  43.51 
 
 		 453 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  39.54 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  36.3 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  36.88 
 
 		 483 aa  249  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  34.33 
 
 		 434 aa  236  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  32.43 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  36.51 
 
 		 493 aa  230  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  31.82 
 
 		 520 aa  230  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  31.36 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  31.66 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  36.51 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  31.59 
 
 		 501 aa  227  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 495 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  31.66 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  31.59 
 
 		 515 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  36.73 
 
 		 493 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  31.59 
 
 		 515 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  31.59 
 
 		 515 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  35.81 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  31.59 
 
 		 515 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  34.35 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  31.35 
 
 		 521 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  30.47 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  30.82 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 531 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  33.87 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  32.21 
 
 		 443 aa  199  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 463 aa  193  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  36.79 
 
 		 491 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  30.17 
 
 		 459 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  36.41 
 
 		 481 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  22.96 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  24.58 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  21.9 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 452 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 452 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 454 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 452 aa  97.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.6 
 
 		 455 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 460 aa  94.4  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  25.43 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  23.14 
 
 		 451 aa  93.2  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  26.01 
 
 		 460 aa  93.2  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.86 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 455 aa  91.3  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 476 aa  90.5  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 451 aa  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  24 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 454 aa  87  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 459 aa  86.7  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  25.13 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  23.5 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  23.86 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  22.06 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  21.26 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  25 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  22.99 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  22.86 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  22.86 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 448 aa  76.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  22.61 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  25.1 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  20.55 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  25.75 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  21.66 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>