More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7265 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 		 491 aa  915    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  79.07 
 
 		 481 aa  621  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  60.33 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  61.9 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  60.47 
 
 		 481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  62.69 
 
 		 493 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  52.94 
 
 		 451 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  50.81 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  46.61 
 
 		 483 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  49.65 
 
 		 453 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  43.18 
 
 		 509 aa  340  5e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  42.47 
 
 		 521 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  44.68 
 
 		 516 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  41.28 
 
 		 501 aa  332  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  41.72 
 
 		 517 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  43.19 
 
 		 520 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  41.98 
 
 		 515 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  43.06 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  41.65 
 
 		 515 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  42.64 
 
 		 505 aa  330  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  42.73 
 
 		 520 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  41.44 
 
 		 515 aa  329  8e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  41.53 
 
 		 505 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  42.96 
 
 		 515 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  42.63 
 
 		 495 aa  323  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  43.85 
 
 		 486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  44.97 
 
 		 465 aa  313  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  42.26 
 
 		 531 aa  306  7e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  40.77 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  35.45 
 
 		 442 aa  290  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  43.72 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  38.44 
 
 		 443 aa  282  9e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  37.91 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  36.79 
 
 		 458 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  38.64 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  35.5 
 
 		 446 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 454 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  24.76 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 453 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  25 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 455 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  27.29 
 
 		 460 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 466 aa  113  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 456 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 460 aa  113  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 451 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 452 aa  106  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 476 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  30.63 
 
 		 478 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  21.54 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.93 
 
 		 454 aa  96.7  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  28.74 
 
 		 477 aa  95.9  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  29.14 
 
 		 454 aa  90.9  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 454 aa  90.1  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  27.19 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  25.25 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25 
 
 		 456 aa  86.7  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 477 aa  86.7  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  30.45 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  28.96 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  22.93 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  23.15 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  22.28 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  22.06 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 500 aa  79.7  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.05 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  22.87 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  22.26 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>