More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0383 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  100 
 
 
451 aa  884    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  100 
 
 
451 aa  884    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  50.67 
 
 
450 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  40.52 
 
 
460 aa  318  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  38.41 
 
 
459 aa  292  9e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  36.14 
 
 
447 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
462 aa  234  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  30.5 
 
 
485 aa  220  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  29.8 
 
 
454 aa  204  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
440 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.05 
 
 
455 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
452 aa  160  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
439 aa  159  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
455 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  30.54 
 
 
468 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  27.53 
 
 
456 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  29.35 
 
 
453 aa  149  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
461 aa  147  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  28.74 
 
 
464 aa  146  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
442 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.83 
 
 
477 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  29.69 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  27.32 
 
 
455 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  29.45 
 
 
437 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  27.1 
 
 
460 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
440 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.47 
 
 
448 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  26.29 
 
 
464 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.2 
 
 
454 aa  137  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  28.01 
 
 
454 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  26.21 
 
 
442 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.46 
 
 
460 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
461 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.2 
 
 
447 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  28.03 
 
 
455 aa  133  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  26.4 
 
 
447 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.47 
 
 
452 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  24.89 
 
 
478 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  30.5 
 
 
489 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  26.82 
 
 
466 aa  126  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
462 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.38 
 
 
460 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  28.04 
 
 
448 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
449 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  26.04 
 
 
452 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  25.58 
 
 
454 aa  124  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  24.88 
 
 
452 aa  124  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  27.38 
 
 
451 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.63 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.4 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.52 
 
 
457 aa  121  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  24.58 
 
 
469 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
454 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
868 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.58 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.07 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.58 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.58 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.98 
 
 
460 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.15 
 
 
461 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  24.34 
 
 
469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  27.4 
 
 
496 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.43 
 
 
469 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  24.32 
 
 
469 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.33 
 
 
460 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  25.98 
 
 
448 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.45 
 
 
469 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  24.43 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  27.2 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  25 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  22.84 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  24.33 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.37 
 
 
484 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.55 
 
 
485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  26.71 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.47 
 
 
455 aa  114  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  24 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  23.74 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
453 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.66 
 
 
451 aa  110  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.43 
 
 
454 aa  110  5e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  26.11 
 
 
460 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
458 aa  110  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.14 
 
 
455 aa  110  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  32 
 
 
454 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  24.47 
 
 
451 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  28.34 
 
 
467 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>