153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2187 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 446 aa  863    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  48.4 
 
 		 453 aa  359  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  45.64 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  39.54 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  35.65 
 
 		 451 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  35.53 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  36.39 
 
 		 481 aa  193  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 509 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.95 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  34.47 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  35.5 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  31.38 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 503 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  33.26 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  33.64 
 
 		 493 aa  167  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 516 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 517 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 515 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 515 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 515 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  30.53 
 
 		 521 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  31.04 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  36.69 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  33.79 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  27.71 
 
 		 486 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  29 
 
 		 531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 505 aa  143  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 462 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 452 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 455 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  24.36 
 
 		 456 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 455 aa  87  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 455 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 452 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  25.41 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  21.48 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  23.27 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  22.98 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  25.15 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  21.7 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  21.82 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 499 aa  63.2  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  23.19 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  19.69 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  24.43 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  22.14 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 485 aa  59.7  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  21.38 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  20.83 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 445 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  22.12 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  22.96 
 
 		 461 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 468 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  23.7 
 
 		 485 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  22.98 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  21.68 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  21.81 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  22.55 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  22.12 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  22.12 
 
 		 453 aa  54.3  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  22.96 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  21.78 
 
 		 485 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 462 aa  53.9  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  21.94 
 
 		 460 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  22.83 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  19.72 
 
 		 518 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  21.94 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>