More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2814 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  89.14 
 
 		 479 aa  781    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 		 493 aa  936    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  98.38 
 
 		 493 aa  924    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  66.59 
 
 		 481 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  62.69 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  61.39 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  50.56 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  46.36 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  48.02 
 
 		 434 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  43.79 
 
 		 520 aa  339  8e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  42.92 
 
 		 517 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  44.93 
 
 		 520 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  45.29 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  44.6 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  45.29 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  45.29 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  45.29 
 
 		 515 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  41.39 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  42.38 
 
 		 505 aa  330  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  42.15 
 
 		 503 aa  329  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  41.54 
 
 		 521 aa  324  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  47.41 
 
 		 453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  43.93 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  44.83 
 
 		 516 aa  316  8e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  43.12 
 
 		 495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  43.68 
 
 		 531 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  41.39 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  42.86 
 
 		 463 aa  292  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  36.38 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  41.51 
 
 		 443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  41.1 
 
 		 486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  41.36 
 
 		 459 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  36.73 
 
 		 458 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  36.79 
 
 		 453 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  36.17 
 
 		 453 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  33.41 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.87 
 
 		 454 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 462 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 453 aa  133  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  28 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  26.44 
 
 		 460 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 460 aa  113  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  23.71 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  25.41 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  28 
 
 		 452 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 453 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 467 aa  106  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 455 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 456 aa  103  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 478 aa  101  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 466 aa  100  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  26.24 
 
 		 444 aa  97.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 462 aa  97.1  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 459 aa  96.7  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 476 aa  94.4  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  21.74 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 468 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 454 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  25 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  23.95 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.71 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  24.53 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  22.66 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  24.25 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  28.22 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>