More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2626 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  100 
 
 		 467 aa  922    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  34.38 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  35.76 
 
 		 462 aa  249  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  36.23 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  33.95 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  32.24 
 
 		 451 aa  227  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  31.36 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 455 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  34.76 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  34.4 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  31.66 
 
 		 452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  34.71 
 
 		 455 aa  220  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  31.44 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  31.44 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  32.27 
 
 		 453 aa  216  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  32.24 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  33.65 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  31.29 
 
 		 456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  34.99 
 
 		 460 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  31.29 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  33.82 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  30.59 
 
 		 476 aa  186  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  32.11 
 
 		 478 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  31.52 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29 
 
 		 458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 460 aa  163  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  30.82 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.38 
 
 		 463 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 466 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 518 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  31.77 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 445 aa  126  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 460 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 469 aa  123  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  30.98 
 
 		 480 aa  123  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  26.75 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  26.75 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  26.75 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  26.44 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  26.44 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1345  multi anti extrusion protein MatE  27.11 
 
 		 459 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.71 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  27.02 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.36 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 520 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 453 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  26.41 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.7 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 515 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 515 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 455 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 456 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 460 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  24.44 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  26.48 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  22.82 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.96 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 498 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  25 
 
 		 481 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 454 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 470 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.04 
 
 		 454 aa  109  9.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>