More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1790 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  869    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1507  mate efflux family protein  63.57 
 
 		 446 aa  550  1e-155  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  34.38 
 
 		 463 aa  256  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  33.71 
 
 		 458 aa  247  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 458 aa  246  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 484 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 457 aa  236  7e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  29.78 
 
 		 470 aa  209  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  33.5 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  28.46 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  28.72 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  30 
 
 		 461 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 448 aa  123  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 454 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 449 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  27.57 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 454 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 468 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 486 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  24.45 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 462 aa  107  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 454 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 467 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 476 aa  106  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  24.93 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  26.59 
 
 		 460 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 455 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 499 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 454 aa  103  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 451 aa  103  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 500 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  23.08 
 
 		 496 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 453 aa  100  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  25 
 
 		 460 aa  99.8  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  22.02 
 
 		 475 aa  99.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.15 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.15 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  25.14 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 485 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  24.82 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26 
 
 		 450 aa  97.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  25.06 
 
 		 428 aa  96.7  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 456 aa  96.7  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  23.78 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  25.93 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 520 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 501 aa  94.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  22.97 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 517 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 520 aa  94  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 453 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 516 aa  93.2  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>