More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1699 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  84.2 
 
 		 515 aa  852    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  87.3 
 
 		 501 aa  851    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  84.2 
 
 		 515 aa  855    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  84.01 
 
 		 515 aa  851    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  73.18 
 
 		 516 aa  709    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  71.98 
 
 		 503 aa  730    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  71.73 
 
 		 509 aa  718    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  98.08 
 
 		 520 aa  1017    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  97.31 
 
 		 517 aa  979    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  73.02 
 
 		 521 aa  712    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  74.41 
 
 		 505 aa  717    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  100 
 
 		 520 aa  1035    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  70.31 
 
 		 505 aa  678    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  85.99 
 
 		 531 aa  837    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  84.39 
 
 		 515 aa  853    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  74.8 
 
 		 495 aa  704    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  53.67 
 
 		 486 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  47.95 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  50.46 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  49.77 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  44.23 
 
 		 459 aa  359  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  47.32 
 
 		 463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  45.81 
 
 		 451 aa  349  5e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  40.81 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  43.33 
 
 		 434 aa  346  6e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  44.11 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  43.42 
 
 		 479 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  45.06 
 
 		 493 aa  330  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  41.97 
 
 		 481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  44.83 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  44.94 
 
 		 481 aa  301  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  43.19 
 
 		 491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  31.13 
 
 		 453 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  30.65 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  32.08 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 451 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  30.28 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 456 aa  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 452 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 478 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 452 aa  134  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 452 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  26 
 
 		 445 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  25 
 
 		 428 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 439 aa  130  8.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  25 
 
 		 452 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  25.12 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  25.89 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 462 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  26.54 
 
 		 444 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  25.87 
 
 		 427 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  30.21 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.48 
 
 		 455 aa  113  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 455 aa  110  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 454 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  28.42 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  27.09 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 438 aa  107  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 438 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 454 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 458 aa  103  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 448 aa  103  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.17 
 
 		 478 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.98 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 445 aa  103  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.17 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>