More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05345 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 445 aa  880    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  73.15 
 
 		 442 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  89.46 
 
 		 427 aa  772    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  70.52 
 
 		 444 aa  624  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  56.28 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  53.39 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  53.36 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  45.02 
 
 		 443 aa  313  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  35.76 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 453 aa  219  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  32.43 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  33.8 
 
 		 453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  32.11 
 
 		 454 aa  193  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  32.25 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 452 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  30.39 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  31.38 
 
 		 456 aa  186  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 455 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 455 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  32.25 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  30.16 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  31.11 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  32.03 
 
 		 451 aa  183  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 452 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  30.93 
 
 		 459 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  31.6 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  33.41 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  32.6 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 476 aa  166  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  31.06 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  29.6 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 505 aa  133  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 516 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 520 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 517 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 501 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 509 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 503 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 521 aa  123  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 478 aa  123  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 505 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 515 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 499 aa  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 498 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 485 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  28.01 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  22.94 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  24.27 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 453 aa  99.8  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.56 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 458 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 447 aa  99.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.75 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 455 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 460 aa  97.4  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 461 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 447 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  23.34 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 458 aa  95.5  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 486 aa  94  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  22.66 
 
 		 477 aa  93.2  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  22.49 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 455 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 454 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  22.68 
 
 		 456 aa  91.3  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.07 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 455 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 460 aa  90.5  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 447 aa  90.1  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  22.99 
 
 		 451 aa  89.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  22.8 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  24.77 
 
 		 485 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 454 aa  89  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  21.88 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>