More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1822 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  100 
 
 		 440 aa  887    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  46.76 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  36.53 
 
 		 462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  33.49 
 
 		 460 aa  236  8e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 450 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 447 aa  209  8e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 455 aa  209  9e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  32.34 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  26.44 
 
 		 459 aa  199  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  32.63 
 
 		 477 aa  190  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  31.19 
 
 		 455 aa  186  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 455 aa  186  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 460 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 452 aa  179  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 439 aa  176  9e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  29.41 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  31.08 
 
 		 460 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 454 aa  159  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 461 aa  159  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  29.79 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  29.33 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  28.38 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 442 aa  149  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 468 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  30.03 
 
 		 464 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 456 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 454 aa  143  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  26.71 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 460 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 448 aa  139  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  29.33 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.64 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 460 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  28.7 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 437 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 462 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 448 aa  130  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.37 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.59 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 470 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.13 
 
 		 485 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  24.64 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5728  hypothetical protein  25.61 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  29.62 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 466 aa  117  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 462 aa  117  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  25.99 
 
 		 449 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  25.29 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  25 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  25 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 458 aa  111  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  25.71 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  24.26 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  24.26 
 
 		 451 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.85 
 
 		 437 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  23.58 
 
 		 451 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.49 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  23.84 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  24.94 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  24.94 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3521  multi anti extrusion protein MatE  24.48 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>