More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3321 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  100 
 
 		 489 aa  938    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  47.63 
 
 		 868 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5728  hypothetical protein  43.17 
 
 		 470 aa  270  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  30.63 
 
 		 455 aa  180  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 464 aa  171  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.03 
 
 		 464 aa  170  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 450 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1344  MATE efflux family protein  36.94 
 
 		 470 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0877237 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 455 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 451 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 451 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 449 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 447 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 454 aa  160  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  29.58 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  30 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 447 aa  156  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 460 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.82 
 
 		 455 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  27.33 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  29.73 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  28.51 
 
 		 452 aa  154  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 477 aa  153  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.5 
 
 		 461 aa  150  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 447 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 460 aa  148  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.01 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  28 
 
 		 456 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  26.02 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  30.24 
 
 		 485 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 452 aa  136  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  26.33 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 442 aa  133  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  31 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  29.09 
 
 		 454 aa  131  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 453 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 466 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  27 
 
 		 451 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 450 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 442 aa  126  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  26.28 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  26.28 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  25.11 
 
 		 496 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  26.28 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  33.16 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  26.65 
 
 		 546 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 467 aa  120  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  28.26 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  30.1 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2206  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.58 
 
 		 541 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.711563  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  25.92 
 
 		 541 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 458 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  23.29 
 
 		 455 aa  116  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  29.58 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  23.82 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.82 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  27.8 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  26.88 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.06 
 
 		 468 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  24.17 
 
 		 468 aa  114  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.79 
 
 		 478 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  23.48 
 
 		 447 aa  114  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>