More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  100 
 
 		 485 aa  932    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  37.69 
 
 		 459 aa  342  7e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  35.11 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  36.01 
 
 		 460 aa  312  9e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  34 
 
 		 450 aa  269  8e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 451 aa  226  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 451 aa  226  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 462 aa  209  6e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  29.14 
 
 		 447 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 447 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  28.73 
 
 		 454 aa  163  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 477 aa  162  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  29.77 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  27.76 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.27 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.24 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 455 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  25.96 
 
 		 455 aa  130  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 454 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 464 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  23.02 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  22.86 
 
 		 455 aa  120  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  24.66 
 
 		 452 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  22.77 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  25.93 
 
 		 446 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 493 aa  113  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  26.02 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 489 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 453 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  24.87 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  28.86 
 
 		 546 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  22.34 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  25.22 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  22.01 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 468 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 453 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  28.43 
 
 		 541 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 868 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.15 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  22.9 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 460 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  23.94 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.74 
 
 		 450 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2206  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.43 
 
 		 541 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.711563  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  26.61 
 
 		 435 aa  103  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 466 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  23.63 
 
 		 496 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  24.21 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.93 
 
 		 485 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  24.93 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 458 aa  100  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 484 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  22.63 
 
 		 496 aa  99  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  26.63 
 
 		 448 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.77 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 470 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  25.57 
 
 		 478 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 454 aa  97.1  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 450 aa  97.1  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 451 aa  97.1  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 451 aa  96.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.51 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  22.71 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 448 aa  93.6  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  20.89 
 
 		 437 aa  93.2  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  26.24 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.29 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>