More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1483 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  100 
 
 		 456 aa  899    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  97.3 
 
 		 456 aa  855    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  48.21 
 
 		 455 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  47.99 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  39 
 
 		 455 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  39.33 
 
 		 477 aa  312  6.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  39.82 
 
 		 461 aa  309  5e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  39.68 
 
 		 449 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  39.86 
 
 		 454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  36.71 
 
 		 455 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  38.78 
 
 		 454 aa  296  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  38.34 
 
 		 460 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  38.04 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  39.03 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  39.39 
 
 		 464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  35.75 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  36.07 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  40.37 
 
 		 466 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  36.02 
 
 		 442 aa  268  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  36.75 
 
 		 451 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  37.78 
 
 		 456 aa  262  8e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  36.19 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  34.8 
 
 		 447 aa  257  4e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  34.57 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  33.86 
 
 		 448 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  34.09 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  33.8 
 
 		 454 aa  236  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  33.26 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  37.21 
 
 		 451 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  35.38 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 460 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 448 aa  229  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  31.14 
 
 		 496 aa  222  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 442 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 493 aa  217  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 451 aa  216  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  32.71 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.56 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 466 aa  209  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  30.7 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  33.03 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  30.39 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  31.79 
 
 		 496 aa  204  4e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 451 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  30.61 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  30.84 
 
 		 458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  28.11 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  28.11 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  27.88 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 451 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  31.79 
 
 		 462 aa  196  6e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27.71 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  32.8 
 
 		 461 aa  195  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  27.48 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  28.54 
 
 		 466 aa  193  6e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 452 aa  193  7e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  29.36 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  27.76 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  24.94 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  31.25 
 
 		 470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 456 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 459 aa  179  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 447 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.3 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  28.95 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.03 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.72 
 
 		 434 aa  177  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  29.45 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 448 aa  173  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  29.15 
 
 		 452 aa  173  5.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  28.78 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  28.78 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  27.74 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  27.74 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  28.88 
 
 		 450 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  26.82 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  26.51 
 
 		 468 aa  162  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  30.29 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  29.79 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.74 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  26.11 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  27.94 
 
 		 449 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  31.5 
 
 		 454 aa  160  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>