More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1604 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  100 
 
 
450 aa  873    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  61.99 
 
 
452 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  61.31 
 
 
447 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  62.22 
 
 
447 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  42.92 
 
 
448 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  41.31 
 
 
452 aa  334  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  34.4 
 
 
451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  35 
 
 
496 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  34.21 
 
 
455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  33.11 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  34 
 
 
455 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  33.03 
 
 
449 aa  232  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  33.11 
 
 
448 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  33.49 
 
 
467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  32.29 
 
 
458 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  32.77 
 
 
448 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  32.2 
 
 
456 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  30.68 
 
 
446 aa  219  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  30.58 
 
 
455 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  32.66 
 
 
442 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  31.17 
 
 
449 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  32.72 
 
 
445 aa  216  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  32.66 
 
 
440 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  30.93 
 
 
456 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  33.41 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  29.77 
 
 
454 aa  212  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  29.68 
 
 
448 aa  212  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  30.36 
 
 
450 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  30.36 
 
 
450 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  30.6 
 
 
450 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  30.52 
 
 
449 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  30.36 
 
 
451 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  30.36 
 
 
451 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  31.71 
 
 
477 aa  209  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  29.93 
 
 
442 aa  208  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  28.73 
 
 
455 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  29.89 
 
 
465 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  31.18 
 
 
464 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  32.35 
 
 
456 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  31.26 
 
 
447 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  30.93 
 
 
455 aa  203  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  29.16 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.36 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  30.75 
 
 
451 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  30.84 
 
 
452 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  30.75 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  30.53 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  30.75 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  30.75 
 
 
451 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.07 
 
 
447 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  30.84 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.56 
 
 
455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  31.6 
 
 
449 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  30.37 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  30.61 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  30.61 
 
 
451 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  29.78 
 
 
443 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  28.8 
 
 
444 aa  192  7e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  29.54 
 
 
454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  29.88 
 
 
459 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  29.77 
 
 
461 aa  188  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30.82 
 
 
447 aa  187  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  30.79 
 
 
468 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
448 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  27.8 
 
 
451 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  27 
 
 
493 aa  176  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.55 
 
 
459 aa  171  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  27.64 
 
 
466 aa  171  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  29.27 
 
 
460 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  30.57 
 
 
451 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  26.74 
 
 
472 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  28.48 
 
 
455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  28.47 
 
 
442 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  28.74 
 
 
454 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  27.31 
 
 
466 aa  162  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  29.51 
 
 
464 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.1 
 
 
434 aa  160  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  27.83 
 
 
461 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  28.95 
 
 
460 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  28.34 
 
 
435 aa  156  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  27.13 
 
 
456 aa  155  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  27.93 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  26.84 
 
 
446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  26.08 
 
 
466 aa  153  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  30.46 
 
 
445 aa  152  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
461 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  30.24 
 
 
466 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.68 
 
 
447 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.11 
 
 
496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  27.46 
 
 
456 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0874  putative integral membrane protein  28.7 
 
 
439 aa  145  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.512566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
451 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  26.99 
 
 
470 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.38 
 
 
446 aa  143  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.44 
 
 
472 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0373  MATE efflux family protein  27.4 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.06 
 
 
467 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
452 aa  138  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
439 aa  138  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>