More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2315 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  100 
 
 		 470 aa  939    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  53.95 
 
 		 484 aa  490  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  53.1 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  52.41 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  52.35 
 
 		 463 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  50.35 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  34.36 
 
 		 457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1507  mate efflux family protein  32.28 
 
 		 446 aa  246  6.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  29.78 
 
 		 443 aa  216  9e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 460 aa  197  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  30.82 
 
 		 467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.73 
 
 		 485 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 455 aa  153  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 462 aa  153  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 455 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 499 aa  150  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 455 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 455 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.65 
 
 		 468 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 451 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.27 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 454 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 518 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 460 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 554 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.27 
 
 		 485 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.13 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 454 aa  137  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 525 aa  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.52 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  22.03 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 538 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  30.13 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  28.33 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 475 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  28.75 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  28.75 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  28.75 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.49 
 
 		 482 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  28.44 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 477 aa  128  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 452 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  28.42 
 
 		 480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  28.53 
 
 		 469 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.68 
 
 		 461 aa  127  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  28.13 
 
 		 469 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 469 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 469 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 454 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  27.65 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 451 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 498 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  27.19 
 
 		 469 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3317  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 469 aa  123  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.09 
 
 		 478 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.38 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 464 aa  119  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  23.32 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  22.61 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  25.32 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0048  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>