More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0849 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  91.24 
 
 
447 aa  732    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  100 
 
 
447 aa  875    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  93.51 
 
 
452 aa  794    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  61.31 
 
 
450 aa  541  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  44.57 
 
 
448 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  42.63 
 
 
452 aa  347  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  33.79 
 
 
496 aa  270  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
451 aa  266  8e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  33.78 
 
 
467 aa  256  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  34.26 
 
 
448 aa  250  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  31.54 
 
 
455 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  34.77 
 
 
477 aa  243  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  31.93 
 
 
455 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  33.26 
 
 
448 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  31.03 
 
 
454 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  32.13 
 
 
454 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  31.83 
 
 
456 aa  232  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  32.96 
 
 
455 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  32.96 
 
 
455 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  32.37 
 
 
455 aa  230  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  31.05 
 
 
447 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  30.77 
 
 
449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  30.82 
 
 
447 aa  226  7e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  33.1 
 
 
458 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  33.25 
 
 
449 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  31.76 
 
 
446 aa  224  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.28 
 
 
442 aa  224  4e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  32.06 
 
 
451 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  32.06 
 
 
451 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  32.51 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  32.06 
 
 
451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.06 
 
 
451 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  31.75 
 
 
448 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  32.3 
 
 
450 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  32.3 
 
 
450 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  32.54 
 
 
464 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  30.84 
 
 
456 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  31.69 
 
 
449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  32.94 
 
 
450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  30.94 
 
 
448 aa  216  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.91 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  31.32 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  31.45 
 
 
451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  34.39 
 
 
468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  31.32 
 
 
451 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  32.06 
 
 
451 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  31.28 
 
 
443 aa  210  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  31.82 
 
 
451 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  31.1 
 
 
452 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  31.82 
 
 
451 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  31.82 
 
 
451 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  31.34 
 
 
451 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  31.53 
 
 
459 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  31.82 
 
 
451 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  31.1 
 
 
451 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  31.88 
 
 
455 aa  206  8e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  29.66 
 
 
460 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  31.7 
 
 
461 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  30.39 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  30.05 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  30.96 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  31.63 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  29.45 
 
 
444 aa  197  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  31.17 
 
 
440 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  30.92 
 
 
460 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  28.96 
 
 
456 aa  188  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  28.94 
 
 
496 aa  189  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  28.05 
 
 
451 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  31.22 
 
 
447 aa  187  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  28.15 
 
 
448 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  29.53 
 
 
472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
493 aa  184  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.25 
 
 
447 aa  179  8e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  28.81 
 
 
440 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.97 
 
 
446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  27.96 
 
 
466 aa  173  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.05 
 
 
472 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.86 
 
 
461 aa  169  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  25.49 
 
 
466 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  28.74 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  31.93 
 
 
466 aa  167  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.4 
 
 
459 aa  166  6.9999999999999995e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  26.36 
 
 
454 aa  166  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
446 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  28.92 
 
 
456 aa  164  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  29.68 
 
 
470 aa  163  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  28.25 
 
 
455 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.41 
 
 
437 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  28.71 
 
 
451 aa  156  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  28.8 
 
 
435 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  27.63 
 
 
455 aa  152  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.98 
 
 
467 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  26.71 
 
 
451 aa  150  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
451 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.36 
 
 
434 aa  149  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  29.65 
 
 
445 aa  149  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  25.44 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.65 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.65 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>