More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3452 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  100 
 
 		 445 aa  877    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  54.93 
 
 		 434 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  43.83 
 
 		 452 aa  322  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  39.36 
 
 		 440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  37.7 
 
 		 442 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  34.47 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  34.24 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  34.24 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  34.24 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  34.24 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  35.89 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 452 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  33.79 
 
 		 451 aa  246  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 451 aa  243  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  33.11 
 
 		 451 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  33.73 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1225  multi anti extrusion protein MatE  32.95 
 
 		 439 aa  220  5e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.874219  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  31.36 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  34.28 
 
 		 435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.01 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  29.48 
 
 		 496 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.59 
 
 		 437 aa  183  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  30.21 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  30.31 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  29.9 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  31.33 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  30.84 
 
 		 455 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.86 
 
 		 450 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 458 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  29.18 
 
 		 456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  31.21 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.86 
 
 		 455 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  30.91 
 
 		 467 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  30.1 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.33 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.41 
 
 		 448 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  28.83 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  28.89 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  27.83 
 
 		 455 aa  156  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  27.27 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 477 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  27.39 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  28.07 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  27.27 
 
 		 450 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  27.27 
 
 		 450 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  25.58 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  25.58 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.42 
 
 		 459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.13 
 
 		 451 aa  147  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.81 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  25.81 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  26.2 
 
 		 449 aa  142  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3521  multi anti extrusion protein MatE  28.31 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  27 
 
 		 447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  29.32 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  26.78 
 
 		 459 aa  136  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 460 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  25.42 
 
 		 461 aa  133  7.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 470 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  25.76 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  25.66 
 
 		 464 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.88 
 
 		 478 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  26.51 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2061  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  27.66 
 
 		 560 aa  126  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.488699  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  26.15 
 
 		 442 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 460 aa  123  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 454 aa  122  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.29 
 
 		 447 aa  120  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 493 aa  119  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>