More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3521 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3521  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 
455 aa  894    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  41.03 
 
 
450 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  40.37 
 
 
451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  37.3 
 
 
446 aa  300  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  29.34 
 
 
442 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  29.44 
 
 
440 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  31.65 
 
 
451 aa  182  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  27.85 
 
 
445 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  27.12 
 
 
445 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.33 
 
 
459 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  26.35 
 
 
451 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  26.62 
 
 
451 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  26.13 
 
 
452 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  26.62 
 
 
451 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  26.62 
 
 
451 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
451 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
451 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  25.68 
 
 
451 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  25.41 
 
 
451 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  25.45 
 
 
451 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  28.25 
 
 
444 aa  147  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.81 
 
 
434 aa  146  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  25.23 
 
 
440 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  28.64 
 
 
435 aa  137  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27.48 
 
 
448 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.93 
 
 
455 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  30.82 
 
 
446 aa  134  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  24.44 
 
 
461 aa  133  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  26.51 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  28.31 
 
 
458 aa  130  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.37 
 
 
437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.08 
 
 
448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  26.84 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  27.71 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.15 
 
 
455 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.15 
 
 
455 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  24.34 
 
 
455 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  30.43 
 
 
446 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  29.44 
 
 
465 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  28.96 
 
 
468 aa  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  24.48 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  24.15 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  24.24 
 
 
449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  26.59 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  27.48 
 
 
447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
451 aa  120  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  28.07 
 
 
448 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  25 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  26.79 
 
 
452 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  28.57 
 
 
451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  28.57 
 
 
451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.16 
 
 
451 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  22.61 
 
 
447 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  28.16 
 
 
451 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
454 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  27.11 
 
 
442 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.47 
 
 
459 aa  116  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  28.4 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.36 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  24.51 
 
 
477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  27.78 
 
 
448 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  27.78 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  24.48 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  27.78 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  25.35 
 
 
449 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  27.78 
 
 
450 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.48 
 
 
456 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  27.48 
 
 
464 aa  113  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  27.22 
 
 
449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  25.81 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.84 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  27.48 
 
 
443 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.13 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
456 aa  110  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.44 
 
 
454 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  25.84 
 
 
461 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  26.91 
 
 
448 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  28.17 
 
 
442 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
447 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  22.71 
 
 
460 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
442 aa  103  9e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  22.17 
 
 
455 aa  99.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  25.21 
 
 
460 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.34 
 
 
462 aa  97.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  24.17 
 
 
448 aa  97.1  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
455 aa  96.7  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  24.22 
 
 
454 aa  96.3  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  22.87 
 
 
470 aa  96.3  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  24.56 
 
 
460 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0874  putative integral membrane protein  24.94 
 
 
439 aa  95.5  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.512566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  25.4 
 
 
455 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  24.17 
 
 
451 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  24.17 
 
 
451 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  22.82 
 
 
472 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  26.18 
 
 
456 aa  95.1  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  23.04 
 
 
452 aa  94.4  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  25.31 
 
 
455 aa  94.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>