More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0313 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  908    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  64.35 
 
 		 454 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  63.45 
 
 		 454 aa  552  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  60.14 
 
 		 449 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  41.04 
 
 		 455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  41.04 
 
 		 455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  43.14 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  40.37 
 
 		 455 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  37.72 
 
 		 456 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  38.53 
 
 		 477 aa  327  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  37.47 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  39 
 
 		 456 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  38.43 
 
 		 460 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  36.88 
 
 		 447 aa  309  8e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  37.56 
 
 		 449 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  36.88 
 
 		 447 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  40.65 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  37.09 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  39.07 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  38.65 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  36.3 
 
 		 466 aa  286  5.999999999999999e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  32.17 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  36.05 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  36.25 
 
 		 496 aa  274  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 448 aa  273  7e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  35.75 
 
 		 447 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  36.88 
 
 		 461 aa  269  7e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  34.27 
 
 		 455 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  31.82 
 
 		 451 aa  259  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  36.99 
 
 		 455 aa  259  8e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  34.01 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  32.31 
 
 		 496 aa  257  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  34.9 
 
 		 472 aa  256  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  31.11 
 
 		 451 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  31.56 
 
 		 451 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  30.65 
 
 		 452 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  35.52 
 
 		 466 aa  244  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  30.65 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  31.11 
 
 		 451 aa  242  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 451 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  30.89 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 451 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  36.14 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  34.07 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 451 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  31.73 
 
 		 451 aa  236  5.0000000000000005e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  32.79 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  35.02 
 
 		 451 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  32.44 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  31.66 
 
 		 460 aa  226  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  32.28 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  32.28 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  31.59 
 
 		 467 aa  219  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  29.31 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  31.92 
 
 		 462 aa  210  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  28.73 
 
 		 448 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  31.96 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  31.96 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  31.48 
 
 		 448 aa  206  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  32.05 
 
 		 450 aa  206  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 459 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  30.72 
 
 		 449 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  29.58 
 
 		 464 aa  203  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  30.28 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  30.28 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 456 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.73 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  29.48 
 
 		 446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  30.73 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  30.7 
 
 		 442 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  29.67 
 
 		 443 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 440 aa  193  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  29.27 
 
 		 448 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.31 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  29.35 
 
 		 459 aa  189  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  29.93 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  28.47 
 
 		 472 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  31.35 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  26.05 
 
 		 465 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 472 aa  179  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  32.52 
 
 		 451 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  27.87 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 445 aa  170  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  29.05 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  31.03 
 
 		 467 aa  163  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  28.35 
 
 		 468 aa  163  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  28.9 
 
 		 455 aa  162  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 445 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.3 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.32 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>