More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0460 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  100 
 
 		 451 aa  870    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  40.7 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  32.66 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  32.15 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  32.1 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  31.41 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  29.25 
 
 		 456 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  32.52 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  31.47 
 
 		 449 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  29 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  30.02 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  30 
 
 		 455 aa  169  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 455 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30.35 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 458 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 449 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 454 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  30.1 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 451 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 451 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  27.44 
 
 		 496 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  26.64 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  26.64 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.46 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  26.64 
 
 		 451 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 454 aa  144  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  30.54 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  28.07 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.18 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 460 aa  133  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 456 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 493 aa  129  9.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  26.1 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  29.36 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  28.67 
 
 		 452 aa  127  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.64 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  29.29 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 464 aa  124  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.4 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  28.19 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  29.29 
 
 		 450 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  25.79 
 
 		 485 aa  123  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  29.13 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  31.33 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  24.71 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  28.34 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  28.34 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  25.72 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  25.28 
 
 		 496 aa  117  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  25.18 
 
 		 448 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.98 
 
 		 451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 450 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  27.05 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  23.76 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  25.41 
 
 		 459 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  27.29 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  23.48 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.85 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  20.93 
 
 		 451 aa  106  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>