More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3492 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  100 
 
 
485 aa  961    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  57.36 
 
 
478 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  45.34 
 
 
460 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  46.14 
 
 
457 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  44.25 
 
 
460 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  44.47 
 
 
460 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  42.14 
 
 
454 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  42.76 
 
 
467 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  41.69 
 
 
473 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  45.11 
 
 
470 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  41.24 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  41.24 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  40.89 
 
 
455 aa  355  1e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  42.63 
 
 
458 aa  343  4e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  37.11 
 
 
454 aa  315  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.84 
 
 
460 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  42.08 
 
 
210 aa  186  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  30.36 
 
 
455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  30.14 
 
 
477 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  29.45 
 
 
468 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  29.35 
 
 
451 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.9 
 
 
459 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  30.44 
 
 
462 aa  162  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  26.09 
 
 
456 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  33.65 
 
 
467 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  30.48 
 
 
493 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.68 
 
 
467 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.81 
 
 
461 aa  152  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  25.63 
 
 
456 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.61 
 
 
455 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
455 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
538 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  28.12 
 
 
455 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.89 
 
 
453 aa  150  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  25.7 
 
 
484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  29.1 
 
 
462 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
458 aa  146  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
458 aa  147  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0849  multi antimicrobial extrusion protein MatE  37.22 
 
 
190 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.471879  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  28.79 
 
 
457 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.24 
 
 
475 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.28 
 
 
463 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.29 
 
 
453 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.71 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.14 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.63 
 
 
485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.77 
 
 
452 aa  141  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.5 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
439 aa  139  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
454 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  27.08 
 
 
472 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  24.56 
 
 
447 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
460 aa  136  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
470 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  29.71 
 
 
498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  28.67 
 
 
445 aa  134  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
462 aa  133  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.62 
 
 
466 aa  133  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  23.68 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.13 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.48 
 
 
481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.4 
 
 
442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  30.37 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.49 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.6 
 
 
461 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
445 aa  131  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.97 
 
 
500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.85 
 
 
554 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.93 
 
 
447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.46 
 
 
451 aa  130  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.4 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  29.64 
 
 
454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.06 
 
 
461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.02 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.5 
 
 
525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.32 
 
 
500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25.23 
 
 
447 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  28.61 
 
 
455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.29 
 
 
455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
450 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
503 aa  126  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.59 
 
 
470 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.55 
 
 
477 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  27.57 
 
 
505 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
499 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.86 
 
 
475 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
446 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.34 
 
 
500 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.34 
 
 
458 aa  124  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.95 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.7 
 
 
449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  26.33 
 
 
496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.85 
 
 
490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.41 
 
 
460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  27.55 
 
 
451 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  28.83 
 
 
454 aa  121  3e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  27.55 
 
 
451 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.68 
 
 
485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>