More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1446 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  100 
 
 
452 aa  877    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  100 
 
 
439 aa  877    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  31.71 
 
 
449 aa  226  8e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  31.55 
 
 
447 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  31.22 
 
 
447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  35.17 
 
 
447 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  30.52 
 
 
464 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  33.18 
 
 
477 aa  216  9e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.22 
 
 
455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  32.28 
 
 
455 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  31.54 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
455 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  29.5 
 
 
455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  28.64 
 
 
456 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  30.33 
 
 
454 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  30.43 
 
 
449 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
442 aa  186  7e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  29.72 
 
 
466 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  30.44 
 
 
454 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  28.97 
 
 
460 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.89 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  30.52 
 
 
455 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  28.87 
 
 
448 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  29.57 
 
 
440 aa  176  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  29.18 
 
 
456 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  30 
 
 
451 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.31 
 
 
467 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  29.59 
 
 
455 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.09 
 
 
460 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  29.65 
 
 
452 aa  170  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  28.77 
 
 
464 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.98 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  27.97 
 
 
447 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.06 
 
 
460 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  27.07 
 
 
459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  28.44 
 
 
454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  29.71 
 
 
470 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  30.63 
 
 
456 aa  161  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
461 aa  160  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  30.61 
 
 
454 aa  159  9e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  28.74 
 
 
454 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.21 
 
 
472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  31.63 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  29.12 
 
 
457 aa  154  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  26.21 
 
 
451 aa  153  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.47 
 
 
460 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  25.61 
 
 
496 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.98 
 
 
456 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
461 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  28.74 
 
 
455 aa  152  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
451 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
451 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
460 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  24.77 
 
 
472 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  30.1 
 
 
437 aa  149  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  30.1 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  28.02 
 
 
460 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.9 
 
 
468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  25.69 
 
 
448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  28.57 
 
 
451 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  28.81 
 
 
451 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
451 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
451 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  28.57 
 
 
451 aa  146  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  27.99 
 
 
452 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
466 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  27.63 
 
 
451 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  27.25 
 
 
451 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  27.29 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  25.42 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  24.65 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  28.06 
 
 
451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  24.64 
 
 
450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.15 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  25.99 
 
 
459 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
453 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
448 aa  139  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  25.51 
 
 
451 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  25.99 
 
 
466 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  24.57 
 
 
446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  24.6 
 
 
451 aa  137  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  25.93 
 
 
460 aa  137  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  30.24 
 
 
466 aa  137  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
462 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  28.6 
 
 
454 aa  136  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
509 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  26.96 
 
 
450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25.97 
 
 
461 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.99 
 
 
454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  23.94 
 
 
452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
460 aa  133  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  27.88 
 
 
485 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  27.08 
 
 
465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  28.72 
 
 
443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  26.16 
 
 
520 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  24.22 
 
 
464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
520 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  26.16 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>