More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4280 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  100 
 
 		 445 aa  821    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  40.18 
 
 		 451 aa  286  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  30.19 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 477 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30.82 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  33.25 
 
 		 454 aa  170  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.93 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  31.95 
 
 		 448 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 448 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  30.34 
 
 		 455 aa  156  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  29.57 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  29.64 
 
 		 450 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  29.41 
 
 		 450 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  29.41 
 
 		 450 aa  153  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  29.41 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.15 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  29.41 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  31.23 
 
 		 449 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  30.39 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  28.83 
 
 		 451 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  28.25 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.83 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  28.77 
 
 		 496 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 454 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 455 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 456 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  28.44 
 
 		 449 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  26.78 
 
 		 464 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 451 aa  136  8e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  32.8 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1477  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 462 aa  133  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  23.43 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.81 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  24.53 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 451 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  23.86 
 
 		 460 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 452 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  30.92 
 
 		 485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  27.51 
 
 		 546 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  22.77 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 499 aa  126  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.71 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  30.13 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  29.43 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 442 aa  124  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  26.56 
 
 		 541 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 462 aa  123  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  29.98 
 
 		 452 aa  122  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.2 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2206  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.79 
 
 		 541 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.711563  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 454 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  25 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  25 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  27.43 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  24.55 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 452 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  24.55 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  25 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  29.62 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  30.62 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 525 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  25.66 
 
 		 496 aa  114  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>