More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1858 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  100 
 
 		 467 aa  910    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  60.8 
 
 		 454 aa  558  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  60.78 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  59.06 
 
 		 455 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  43.24 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  39.87 
 
 		 478 aa  355  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  45.83 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  41.2 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  40.98 
 
 		 460 aa  343  5e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  40.76 
 
 		 460 aa  342  8e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  39.82 
 
 		 457 aa  330  3e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  39.91 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  41.43 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  39.68 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  37.58 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0849  multi antimicrobial extrusion protein MatE  75.13 
 
 		 190 aa  298  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.471879  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  40.21 
 
 		 210 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 461 aa  139  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  32.17 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 449 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.01 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.99 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.72 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  23.96 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 453 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.59 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.82 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 490 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  25.28 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 554 aa  106  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5728  hypothetical protein  28.92 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 454 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 868 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  22.27 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.1 
 
 		 518 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 462 aa  100  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  25.41 
 
 		 452 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 500 aa  100  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 454 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.93 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.7 
 
 		 467 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  27.34 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 472 aa  97.8  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 493 aa  97.1  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>